Gérés par l'Université de Tokyo, les jardins botaniques de Koishikawa recensent 4,000 espèces de plantes dont 1,400 espèces ligneuses vivaces, 1,500 espèces herbacées vivaces, et 1,100 espèces tropicales et subtropicales.

Ils sont particulièrement fréquentés au moment de la floraison des cerisiers par les familles venues pique-niquer sous les arbres. Un endroit méconnu des touristes, à l'écart des grands centres, mais qui charment par la diversité de sa flore et son impressionnant nombre de sakuras alignés.